موسسه آموزش عالی دانش پژوهان در طرح جامع 5 ساله دوم خود موارد ذیل را به عنوان اهداف اصلی مدنظر قرار داده است:
* تکمیل و راه اندازی ساختمان دانشگاه دانش پژوهان
* توسعه رشته ها در مقاطع کارشناسی و کارشناسی ارشد
* توسعه و تکمیل امکانات کارگاهی و آزمایشگاهی
* جذب و تکمیل کادر هیأت علمی
* راه اندازی دوره های مشترک با دانشگاه های داخل و خارج کشور
* برگزاری کنفرانس های تخصصی با همکاری نهادهای علمی کشور
* راه اندازی مجلات تخصصی